LabDAO در حال ترسیم آینده هوش مصنوعی منبع باز برای کشف دارو است

پروژه Folding@home در سرتاسر همه‌گیری COVID-19 برای به کارگیری قدرت محاسباتی استفاده نشده برای کاوش در فضای جستجوی تاشو پروتئین برای مقابله با کروناویروس جدید، سرفصل خبرها شد. این ابتکار با توانمندسازی شهروندان برای اینکه خودشان دانشمند باشند، شبیه‌سازی‌های مقیاس بزرگی از پیکربندی‌های مولکولی مختلف پروتئین‌ها را در یک شبکه توزیع‌شده از رایانه‌های «ثبت‌شده» در سراسر جهان اجرا کرد.

این پارادایم غیرمتمرکز برای گردهم آوردن مردم پیرامون یک مشکل مشترک و توان محاسباتی جمع سپاری به طور کارآمد اعلام شد، اما اگر قدرت محاسباتی و زیرساخت حل مسئله معکوس شوند، چه؟ به عبارت دیگر، چه می‌شود اگر افراد بتوانند پروژه‌های خود را با بهره‌برداری از قدرت محاسباتی انباشته اجرا کنند و ابزار آزمایش بیولوژیکی برای بوت کردن؟

LabDAO با پلتفرم PLEX خود این رویا را به واقعیت تبدیل می کند. PLEX یک ابزار خط فرمان منبع باز است که نه تنها منابع محاسباتی، بلکه انواع ابزارهای یادگیری ماشینی بیولوژیکی (که مجموعه "BioML" در LabDAO ساخته شده است) در زمینه های مختلف قابل دسترسی است. PLEX چه در حال آزمایش با اتصال مولکول‌های کوچک و چه شبیه‌سازی‌های تاشو پروتئین خود، به کاربران این امکان را می‌دهد تا به کتابخانه ابزارهای LabDAO ضربه بزنند، نتایج را به اشتراک بگذارند و آنها را در کمتر از پنج دقیقه تجسم کنند.

این مجموعه از ابزارها و پلتفرم قابل استفاده آن در بالای آن در نشست Blockchain Meets Biology در Zuzalu در اوایل آوریل به نمایش گذاشته شد، جایی که عضو تیم اصلی LabDAO، لیلی هانسن-گیلیس از ابتدا تا انتها شبیه‌سازی دینامیک مولکولی داخلی را نشان داد. پروتئین برای یافتن پایدارترین پیکربندی خود. سپس، به‌عنوان یک «غیر کدنویس» که خود را معرفی می‌کرد، از ابتدا تا انتها مخاطبان را از طریق آن راهنمایی کرد – همه با یک کامپیوتر، WiFi، PLEX در خط فرمان، و هیچ چیز بیشتر.

به طور گسترده تر، LabDAO یک پلت فرم غیرمتمرکز مبتنی بر وب 3 (بخشی از جنبش بزرگتر "DeSci") است که متعهد به ایجاد محیطی سازنده تر برای کشف دارو با منبع باز است. LabDAO با در دسترس قرار دادن ابزارها و منابع پیشرفته در اکوسیستم گسترده تر، قصد دارد محیط مناسبی برای پیشرفت های علمی شفاف و در دسترس ایجاد کند. چه با حذف نیاز محققان به داشتن سخت‌افزار یا زیرساخت محاسباتی خود یا انتشار نتایج آزمایش‌ها بر روی دفتر کل بلاک چین به‌گونه‌ای که قابل حمل و تکرار باشد، سازمان متعهد است که نوآوری‌های بیشتری را از طریق همکاری ممکن کند - شکستن موانع ناشی از ضعف قابلیت استفاده و siloed، تخصص طاقچه.

تلاش‌های LabDAO برای ساختن این دنیای DeSci آینده برای امروز اخیراً در قالب یک دور سرمایه‌گذاری 3.6 میلیون دلاری از DAO‌های مختلف دیگر، Inflection.xyz، Balaji Srinivasan و دیگران تقویت شده است. این هجوم پشتیبانی به تلاش‌های مداوم برای ایجاد ابزارهای نرم‌افزار منبع باز و تقویت اکوسیستم تحقیقاتی LabDAO کمک خواهد کرد.

در مورد خود PLEX، گام‌های فوری بعدی در افق شامل آزمایش پلت فرم در همکاری‌های علمی مختلف، کانتینر کردن ابزارهای مختلف و جمع‌آوری سخت‌افزار لازم برای تقویت شبکه BioML است.

در مورد طولانی مدت، شاید داروی نجات دهنده بعدی در طول شیوع بیماری عفونی بزرگ بعدی با قدرت PLEX طراحی شود، یک گام غیرمتمرکز به جلو در هر زمان. همانطور که اکوسیستم به رشد خود ادامه می دهد، فقط زمان مشخص خواهد کرد.

با تشکر از شما آیشانی عطرش برای تحقیق و گزارش بیشتر در مورد این مقاله. من بنیانگذار SynBioBeta هستم و برخی از شرکت هایی که درباره آنها می نویسم حامیان مالی آن هستند کنفرانس SynBioBeta. برای مطالب بیشتر می توانید مشترک شوید خبرنامه هفتگی من.

منبع: https://www.forbes.com/sites/johncumbers/2023/06/02/labdao-is-charting-the-future-of-open-source-ai-for-drug-discovery/